在全球气候持续变暖导致珊瑚白化频率加剧的背景下，仍有部分珊瑚显示出了非常高的热适应性，显示出珊瑚对全球变化存在适应的潜力，但其适应机制仍不清楚。本研究选择环境波动较大海域的鹿角杯形珊瑚为研究对象，采用基于纳米孔的第三代全长转录组测序技术，研究波动礁区环境提高鹿角杯形珊瑚耐受性的分子机制。本研究鉴定了1414个新基因，并优化了6256个错误注释的基因座。基于全长转录组数据确定了复杂的AS和APA事件，这将有助于增进对鹿角杯形珊瑚基因组注释和基因结构的了解。此外，本研究发现全部转录本的6.86％是由某种形式的可变剪切事件产生的，其中内含子保留是鹿角杯形珊瑚中最普遍的可变剪切形式。本研究进一步确定了88,092个基因座上的207,955个APA事件。最后，本研究还构建了DE-lncRNA-mRNA共表达网络，这在鹿角杯形珊瑚的热适应性反应中可能起到关键的作用。lncRNA靶向mRNA的KEGG富集分析显示，波动环境下鹿角杯形珊瑚的代谢率低于稳定环境。基于上述结果，本研究认为波动礁区环境提高鹿角杯形珊瑚耐受性可能与机体代谢调整有关，高耐受性的鹿角杯形珊瑚代谢率较低。本研究为探索lncRNA在波动环境提高造礁石珊瑚耐受性的重要作用提供了有力的证据，也为造礁石珊瑚适应未来全球气候变化研究奠定了基础。

该成果发表于SCI二区Top期刊Environmental Research. 文章信息如下：

Yu Xiaopeng, Yu Kefu, Chen Biao, Liao Zhiheng, Qin Zhenjun, Yao Qiucui, Huang Yanhua, Liang Jiayuan, Huang Wen. (2021). Nanopore long-read RNAseq reveals regulatory mechanisms of thermally variable reef environments promoting heat tolerance of scleractinian coral Pocillopora damicornis. Environmental Research, 195: 110782.

 https://doi.org/10.1016/j.envres.2021.110782.